L'hygiène dans les entreprises du secteur agro-alimentaire est une des bases de la maîtrise de la sécurité sanitaire et de la qualité des produits. Les vétérinaires sont impliqués dans le conseil, dans l'accompagnement ou dans le contrôle des bonnes pratiques d'hygiène, et ils sont mêmes parfois impliqués en tant qu'acteurs, lorsqu'ils sont présents sur les chaînes d'abattage par exemple. La justification scientifique ou technique des bonnes pratiques d'hygiène, de nettoyage et de désinfection sont utiles et nécessaires au vétérinaire pour la mise en place des protocoles dans les entreprises et pour remettre en cause certaines pratiques routinières.
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