L'autopsie, surtout dans les élevages avec des groupes d'animaux potentiellement malades ensemble mais à différents stades, est une source d'information importante pour le diagnostic et le suivi de troupeau par le praticien, par l'examen des lésions, par la possibilité de prélèvements et d'examens complémentaires.
La réaliser en salle d'autopsie dans de bonnes conditions est certainement l'idéal, mais il peut y avoir des problèmes d'acheminement des cadavres et des soucis de délai. L'autopsie pourrait dès lors être réalisée en ferme, si elle est faite en respectant les bonnes pratiques : c'est une des motivations de cette formation pratique.
Mais comprendre les procédures mises en ouvre et les difficultés rencontrées par les confrères au laboratoire est aussi intéressant pour affiner la démarche des praticiens de terrain dans leurs demandes et leurs interprétations des résultats.
La formation ne sera pas orientée vers des pathologies spécifiques, elle se concentrera sur les aspects techniques, même si des éléments de diagnostic différentiels seront abordés pour faire le lien avec les éléments cliniques qui font le quotidien des praticiens.
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